协同创新中心已分别与美国约翰霍普金斯大学、南伊利诺斯大学、匹兹堡大学、佛罗里达大学、德州大学圣安东尼奥医学中心、克利夫兰医疗基地、加拿大麦吉尔大学、澳大利亚悉尼大学、澳大利亚皇家理工学院、西悉尼大学、新加坡国立大学等海外10余所顶尖知名高校在科学研究和人才培育方面进行全方位深度合作，并承担了欧盟第7框架项目《有机催化方法合成易得、经济和高产的达菲及其衍生物》、973分课题《肿瘤恶性生物学行为的重要分子事件的动态可视化》和科技部重大新药创制十一五专项分课题《新药临床前药效学评价技术平台建设》等国际国内合作重大项目。